A pathway for every product? Tools to discover and design plant metabolism

تنوع گسترده محصولات طبیعی گیاهی نشان دهنده قدرتمند بودن ظرفیت بیوسنتز متابولیسم گیاه می باشد. زیست شناسی مصنوعی به دنبال این توانایی با استفاده از درک و بازسازی مسیرهای بیوسنتز است که این تنوع را برای تولید محصولات نوین با کارایی بهتر بهبود می بخشد. در اینجا الگوریتم ها و پایگاه های داده ای را بررسی می کنیم که در حال حاضر از طراحی و دستکاری مسیرهای متابولیک در گیاهان حمایت می کند، از مدل های متابولیک مسیرهای بیوسنتز بومی، پیشرفت به ترکیب های جدید از واکنش های شناخته شده، و در نهایت پیشنهاد واکنش های جدیدی که توسط آنزیم های موجود انجام می شود . ما نشان می دهیم که چگونه این ابزار ها برای پیشنهاد مسیرهای جدید مفید هستند و همچنین شناسایی واکنش های جانبی که ممکن است بر اهداف مهندسی تاثیر بگذارد.