کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8384618 | 1543653 | 2014 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The Leinster and Cobbold indices improve inferences about microbial diversity
ترجمه فارسی عنوان
شاخص های لینستر و کوببولد نتیجه گیری های مربوط به تنوع میکروبی را بهبود می بخشد
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
قارچ میکوریزا آربوسکول، بوت استرپینگ، اعداد هیل، شباهت تاکسونهای فیلوژنتیک،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
بوم شناسی، تکامل، رفتار و سامانه شناسی
چکیده انگلیسی
An increasing number of ecological studies compare the diversity of microbial taxa along environmental gradients or between imposed treatments. Estimates are often based on analysis-of-variance of taxon-richness inferred from pyrosequencing data. We conducted a reanalysis of three 454-pyrosequencing studies on arbuscular-mycorrhizal-fungal diversity to evaluate the suitability of using the Leinster and Cobbold diversity-indices (LCdis) to assess diversity. We expected that the potential of LCdis to consider phylogenic relationships could resolve problems arising from ambiguous species-delineation in microbial-systems. Our reanalysis showed that comparisons between studies differing considerably in sequencing depth may be risky. Moreover, we show that LCdis not only reproduce the results of analyses of variance but can also resolve issues connected to variation in sequence read number, while additionally representing a less conservative metric of diversity than analysis-of-variance of taxa-richness. Based on these results we advocate the use of inclusive diversity indices in ecological studies targeting microbial communities.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Fungal Ecology - Volume 11, October 2014, Pages 1-7
Journal: Fungal Ecology - Volume 11, October 2014, Pages 1-7
نویسندگان
Stavros D. Veresoglou, Jeff R. Powell, John Davison, Ylva Lekberg, Matthias C. Rillig,