کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8392942 | 1544052 | 2017 | 59 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Establishment of a de novo Reference Transcriptome of Histomonas meleagridis Reveals Basic Insights About Biological Functions and Potential Pathogenic Mechanisms of the Parasite
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
LGTHistomonas meleagridisTRICLRRGFPTIMPFTADPROS - ROSAdenosine Triphosphate - آدنوزین تری فسفاتATP - آدنوزین تری فسفات یا ATPadenosine diphosphate - آدنوزین دی فسفاتBasic Local Alignment Search Tool - ابزار جستجوی محلی سازگاری محلیLateral gene transfer - انتقال ژن جانبیPFOR - انجمن اولیا و مربیانBlast - انفجارTranscriptome - ترانسکریپتومpore-forming toxin - توکسین مولکولیLeucine rich repeat - تکرار غنی از لوسینProtozoa - تکیاختگانde novo sequencing - دوباره توالیSOD - سدSuperoxide dismutase - سوکسوکس دیسموتازTCP - قرارداد هدایت انتقالNitric oxide - نیتریک اکسیدGene ontology - هستیشناسی ژنیVirulence - ویروسی شدنgreen fluorescent protein - پروتئین فلورسنت سبزAdhesion protein - پروتئین چسبندگیCysteine peptidase - پپتیداز سیتئینReactive oxygen species - گونههای فعال اکسیژن
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
The protozoan flagellate Histomonas meleagridis is the causative agent of histomonosis in poultry. In turkeys, high mortality might be noticed whereas in chickens the disease is less severe despite production losses. Discovered over a century ago, molecular data on this parasite are scarce and genetic studies are in its infancy. To expand genomic information, a de novo transcriptome sequencing of H. meleagridis was performed from a virulent and an attenuated strain, cultivated in vitro as monoxenic mono-eukaryotic culture. Normalized cDNA libraries were prepared and sequenced on Roche 454 GS FLX resulting in 1.17 million reads with an average read length of 458Â bp. Sequencing reads were assembled into two sets of >4500 contigs, which were further integrated to establish a reference transcriptome for H. meleagridis consisting of 3356 contigs. Following gene ontology analysis, data mining provided novel biological insights into proteostasis, cytoskeleton, metabolism, environmental adaptation and potential pathogenic mechanisms of H. meleagridis. Finally, the transcriptome data was used to perform an in silico drug screen to identify potential anti-histomonal drugs. Altogether, data recruited from virulent and attenuated parasites facilitate a better understanding of the parasites' molecular biology aiding the development of novel diagnostics and future research.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Protist - Volume 168, Issue 6, December 2017, Pages 663-685
Journal: Protist - Volume 168, Issue 6, December 2017, Pages 663-685
نویسندگان
Rounik Mazumdar, Lukas Endler, Andreas Monoyios, Michael Hess, Ivana Bilic,