کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8420286 1545892 2018 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Label-free Raman characterization of bacteria calls for standardized procedures
ترجمه فارسی عنوان
مشخص کردن خصوصیات رامان از باکتری ها برای روش های استاندارد شده
کلمات کلیدی
شناسایی فنوتیپ، طیف سنجی رامان بدون برچسب، تجزیه و تحلیل تک سلولی، استاندارد سازی رامان،
ترجمه چکیده
طیف سنجی رامان در ارتباط با میکروب شناسی تک سلولی برای توانایی آن برای تشخیص جمعیت باکتری (زیر) در یک روش غیر مخرب و بدون برچسب است. با این حال، طیف رامان یک باکتری می تواند به شدت تحت تاثیر عوامل بی هویت قرار گیرد که ممکن است بر تفسیر نتایج آزمایش تاثیر بگذارد. علاوه بر این، هیچ استاندارد عمومی برای حاشیه نویسی ابردادهای که توصیف تهیه نمونه و کسب طیف رامان نیست، وجود ندارد. در این مقاله اهمیت دستکاری نمونه ها در هنگام اندازه گیری زیرمجموعه های باکتریایی با استفاده از طیف سنجی رامان مورد بررسی قرار می گیرد. بر اساس نتایج این تحقیق و یافته های قبلی در ادبیات، ما یک استاندارد فراداده رامان را پیشنهاد می دهیم که شامل حداقل اطلاعاتی است که مورد نیاز است تا بتواند داده ها را از آزمایشات طیف سنجی رامان به درستی تفسیر کند. هدف آن دو برابر است: 1) کاهش سر و صدای فنی به دلیل آماده سازی نمونه و دستکاری و 2) بهبود قابل بازیافت در آزمایشات طیف سنجی رامان مطالعه جوامع میکروبی.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی بیوتکنولوژی یا زیست‌فناوری
پیش نمایش مقاله
مشخص کردن خصوصیات رامان از باکتری ها برای روش های استاندارد شده
چکیده انگلیسی
Raman spectroscopy has gained relevance in single-cell microbiology for its ability to detect bacterial (sub)populations in a non-destructive and label-free way. However, the Raman spectrum of a bacterium can be heavily affected by abiotic factors, which may influence the interpretation of experimental results. Additionally, there is no publicly available standard for the annotation of metadata describing sample preparation and acquisition of Raman spectra. This article explores the importance of sample manipulations when measuring bacterial subpopulations using Raman spectroscopy. Based on the results of this study and previous findings in literature we propose a Raman metadata standard that incorporates the minimum information that is required to be reported in order to correctly interpret data from Raman spectroscopy experiments. Its aim is twofold: 1) mitigate technical noise due to sample preparation and manipulation and 2) improve reproducibility in Raman spectroscopy experiments studying microbial communities.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Microbiological Methods - Volume 151, August 2018, Pages 69-75
نویسندگان
, , , , , , , ,