کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8645438 | 1569786 | 2018 | 31 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Co-located hAT transposable element and 5S rDNA in an interstitial telomeric sequence suggest the formation of Robertsonian fusion in armored catfish
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
SDSCTABITSRDNAORFrRNANTSDAPINHEJ4′,6-diamidino-2-phenylindole - 4 '، 6-دیامیدینو-2-فنیلینولDNA coding for rRNA - DNA کدگذاری برای rRNAdNTPS - DNTPSRibosomal RNA - RNA Ribosomalcetyltrimethylammonium bromide - اتلی تریمتیل آمونیوم برومیدChromosomal rearrangements - تغییرات کروموزومیSegmental duplications - تکثیر سگمنتیشنbase pair - جفت پایهdeoxyribonucleoside triphosphate - دز اکسید ریبونوکلئوزید تری فسفاتnon-homologous end joining - عدم پیوستن انتهای غیر همولوگTransposable element - عنصر قابل حملfluorescence in situ hybridization - فلورسانس در هیبریداسیون در محلopen reading frame - قاب خواندن بازFish - ماهیpolymerase chain reactions - واکنش های زنجیره ای پلیمرازHAT - کلاه
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Co-located 5S rDNA genes and interstitial telomeric sites (ITS) revealed the involvement of multiple 5S rDNA clusters in chromosome rearrangements of Loricariidae. Interstitial (TTAGGG)n vestiges, in addition to telomeric sites, can coincide with locations of chromosomal rearrangements, and they are considered to be hotspots for chromosome breaks. This study aimed the molecular characterization of 5S rDNA in two Rineloricaria latirostris populations and examination of roles of 5S rDNA in breakpoint sites and its in situ localization. Rineloricaria latirostris from Brazil's Das Pedras river (2nâ¯=â¯46 chromosomes) presented five pairs identified using a 5S rDNA probe, in addition to a pair bearing a co-located ITS/5S rDNA. Rineloricaria latirostris from the Piumhi river (2nâ¯=â¯48 chromosomes) revealed two pairs containing 5S rDNA, without ITS. A 702-bp amplified sequence, using 5S rDNA primers, revealed an insertion of the hAT transposable element (TE), referred to as a degenerate 5S rDNA. Double-FISH (fluorescence in situ hybridization) demonstrated co-localization of 5S rDNA/degenerate 5S rDNA, 5S rDNA/hAT and ITS/5S rDNA from the Das Pedras river population. Piumhi river isolates possessed only 5S rDNA sites. We suggest that the degenerate 5S rDNA was generated by unequal crossing over, which was driven by invasion of hAT, establishing a breakpoint region susceptible to chromosome breakage, non-homologous recombination and Robertsonian (Rb) fusion. Furthermore, the presence of clusters of 5S rDNA at fusion points in other armored catfish species suggests its re-use and that these regions represent hotspots for evolutionary rearrangements within Loricariidae genomes.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 650, 15 April 2018, Pages 49-54
Journal: Gene - Volume 650, 15 April 2018, Pages 49-54
نویسندگان
Larissa Glugoski, Lucia Giuliano-Caetano, Orlando Moreira-Filho, Marcelo R. Vicari, Viviane Nogaroto,