کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8645826 | 1569794 | 2018 | 52 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Discerning molecular interactions: A comprehensive review on biomolecular interaction databases and network analysis tools
ترجمه فارسی عنوان
درک متقابل مولکولی: یک بررسی جامع در مورد پایگاه داده های متابولیسم بیولوژیکی و ابزارهای تجزیه و تحلیل شبکه
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
IMExDPVHPRDPTMsIIDSTRINGDIPMCLNEMOCOGs - COG هاsearch tool for the retrieval of interacting genes/proteins - ابزار جستجو برای بازیابی ژن / پروتئین های تعامل استSpike - اسپایکPVM - تاریخEPR - تشدید پارامغناطیس الکترونProtein-protein interaction - تعامل پروتئین-پروتئینGene interaction - تعامل ژنProtein-protein interactions - تعاملات پروتئین-پروتئینGenetic interactions - تعاملات ژنتیکیpost-translational modifications - تغییرات پس از ترجمه، پیرایش پساترجمهTopology - توپولوژیCluster of Orthologous Groups - خوشه گروه های OrthologousKEGG یا Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایرة المعارف ژن ها و ژنوم کیوتو Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایره المعارف ژنتیک ژن ها و ژنوم کیوتوDAVID - دیویدEASE - سهولتInteraction networks - شبکه های تعاملfunctional enrichment - غنی سازی عملکردیGiant - غولURL - نشانی اینترنتیMint - نعناGene ontology - هستیشناسی ژنیdatabase for annotation, visualization and integrated discovery - پایگاه داده برای حاشیه نویسی، تجسم و کشف یکپارچهHuman Protein Reference Database - پایگاه داده مرجع پروتئین انسانیDatabases - پایگاه داده هاDatabase of Interacting Proteins - پایگاه داده پروتئین های تعاملPINA - پینا
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
چکیده انگلیسی
Computational analysis of biomolecular interaction networks is now gaining a lot of importance to understand the functions of novel genes/proteins. Gene interaction (GI) network analysis and protein-protein interaction (PPI) network analysis play a major role in predicting the functionality of interacting genes or proteins and gives an insight into the functional relationships and evolutionary conservation of interactions among the genes. An interaction network is a graphical representation of gene/protein interactome, where each gene/protein is a node, and interaction between gene/protein is an edge. In this review, we discuss the popular open source databases that serve as data repositories to search and collect protein/gene interaction data, and also tools available for the generation of interaction network, visualization and network analysis. Also, various network analysis approaches like topological approach and clustering approach to study the network properties and functional enrichment server which illustrates the functions and pathway of the genes and proteins has been discussed. Hence the distinctive attribute mentioned in this review is not only to provide an overview of tools and web servers for gene and protein-protein interaction (PPI) network analysis but also to extract useful and meaningful information from the interaction networks.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 642, 5 February 2018, Pages 84-94
Journal: Gene - Volume 642, 5 February 2018, Pages 84-94
نویسندگان
Sravan Kumar Miryala, Anand Anbarasu, Sudha Ramaiah,