کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10231911 1395 2011 11 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Comparison of linear gap penalties and profile-based variable gap penalties in profile-profile alignments
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی شیمی بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
Comparison of linear gap penalties and profile-based variable gap penalties in profile-profile alignments
چکیده انگلیسی
► We compared two linear gap penalties with two profile-based gap penalties. ► We examine alignment accuracy improvements brought by profile-based gap penalties. ► Profile-based gap penalties get limited improvements than linear gap penalties. ► Secondary structure is less powerful in gap penalties than in scoring functions. ► The maximal potential of the indel frequency profiles remains to be discovered.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computational Biology and Chemistry - Volume 35, Issue 5, 12 October 2011, Pages 308-318
نویسندگان
, , , , ,