کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10556181 | 968247 | 2011 | 11 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
RT-SVRÂ +Â q: A strategy for post-mascot analysis using retention time and q value metric to improve peptide and protein identifications
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
SVRFDRPSMMHTRPLCMS/MS - MS / MSQ value - ارزش Qmit - باDatabase search - جستجوی پایگاه دادهRetention time - زمان بازداریPeptide identification - شناسایی پپتیدهTandem mass spectrometry - طیف سنجی جرمی پشت سر هم یا متوالیfalse discovery rate - میزان کشف کاذبpeptide spectrum match - پتیدی طیف بازیShotgun proteomics - پروتئومیکس تفنگ ساچمهایReversed phase liquid chromatography - کروماتوگرافی مایع فاز برگشتی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
شیمی
شیمی آنالیزی یا شیمی تجزیه
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
⺠A machine learning approach using retention time based support vector regressor (RT-SVR) is described. ⺠The application of RT-SVR model on Mascot results increases the accuracy and sensitivity of peptide identifications. ⺠q Value metric, as a function of ÎRT, is used for the first time to assess the significance of peptide identifications. ⺠Peptide and protein identifications increase by up to 89.4% and 83.5%, respectively, for NKL cells proteomic analysis. ⺠A user-friendly Windows-based software is available for free download.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Proteomics - Volume 75, Issue 2, 21 December 2011, Pages 480-490
Journal: Journal of Proteomics - Volume 75, Issue 2, 21 December 2011, Pages 480-490
نویسندگان
Weifeng Cao, Di Ma, Arvinder Kapur, Manish S. Patankar, Yadi Ma, Lingjun Li,