کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10605792 | 982874 | 2010 | 4 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Glycan flexibility: insights into nanosecond dynamics from a microsecond molecular dynamics simulation explaining an unusual nuclear Overhauser effect
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
شیمی
شیمی آلی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
An atomistic all-atom molecular dynamics simulation of the trisaccharide β-d-ManpNAc-(1â4)[α-d-Glcp-(1â3)]-α-l-Rhap-OMe with explicit solvent molecules has been carried out. The trisaccharide represents a model for the branching region of the O-chain polysaccharide of a strain from Aeromonas salmonicida. The extensive MD simulations having a 1-μs duration revealed a conformational dynamics process on the nanosecond time scale, that is, a 'time window' not extensively investigated for carbohydrates to date. The results obtained from the MD simulation underscore the predictive power of molecular simulations in studies of biomolecular systems and also explain an unusual nuclear Overhauser effect originating from conformational exchange.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Carbohydrate Research - Volume 345, Issue 2, 26 January 2010, Pages 330-333
Journal: Carbohydrate Research - Volume 345, Issue 2, 26 January 2010, Pages 330-333
نویسندگان
Jens Landström, Göran Widmalm,