کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10761302 1050465 2012 4 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
An efficient algorithm for DNA fragment assembly in MapReduce
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
An efficient algorithm for DNA fragment assembly in MapReduce
چکیده انگلیسی
► We develop a sequence assembly parallel algorithm, which avoids de Bruijin graph division, using the MapReduce framework. ► The method overcomes memory limitations in large sequence assembly by distributing de Bruijn graph. ► The method implies MapReduce is an ideal solution for sequence assembly algorithm.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 426, Issue 3, 28 September 2012, Pages 395-398
نویسندگان
, , ,