کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10800047 1054612 2015 12 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Correcting for the free energy costs of bond or angle constraints in molecular dynamics simulations
ترجمه فارسی عنوان
اصلاح هزینه های انرژی آزاد محدودیت های اتصال یا زاویه در شبیه سازی های پویایی مولکولی
کلمات کلیدی
محاسبه انرژی آزاد، اصلاح محدودیت، شبیه سازی دینامیک مولکولی، تجزیه و تحلیل حالت طبیعی، نسبت پذیرش بنت،
ترجمه چکیده
ابزار اصلی این روش، محاسبه انرژی های آزاد برای سیستم های با سطوح مختلف انرژی و شرایط اتصال، به ویژه در شبیه سازی مکانیک مولکولی مولکولی / مکانیک کوانتومی است. این مقاله بخشی از یک موضوع ویژه به نام "پیشرفت های اخیر دینامیک مولکولی" است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
پیش نمایش مقاله
اصلاح هزینه های انرژی آزاد محدودیت های اتصال یا زاویه در شبیه سازی های پویایی مولکولی
چکیده انگلیسی
The primary utility of this approach is to calculate free energies for systems with disparate energy surfaces and bonded terms, especially in multi-scale molecular mechanics/quantum mechanics simulations. This article is part of a Special Issue entitled Recent developments of molecular dynamics.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects - Volume 1850, Issue 5, May 2015, Pages 932-943
نویسندگان
, ,