کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10825632 1064660 2014 15 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Digital pathology and image analysis in tissue biomarker research
ترجمه فارسی عنوان
آسیب شناسی دیجیتال و تحلیل تصویر در تحقیقات بیومارکر بافت
ترجمه چکیده
آسیب شناسی دیجیتالی و پذیرش تحلیل تصویر در چند سال اخیر به سرعت در حال افزایش است. این امر عمدتا به دلیل اجرای اسکن کامل اسلاید، پیشرفت در نرم افزار و ظرفیت پردازش کامپیوتری و اهمیت فزاینده تحقیقات مبتنی بر بافت برای کشف بیومارکر و طب سنتی است. این بررسی از مناطق کاربردی کلیدی برای آسیب شناسی دیجیتال و تجزیه و تحلیل تصویر، با تمرکز خاص بر کشف تحقیق و بیومارکر، را مشخص می کند. انواع نرم افزارهای آنالیز تصویر از جمله مورفومتری هسته ای و تجزیه و تحلیل معماری بافتی مورد بررسی قرار می گیرند، اما با تاکید بر تجزیه و تحلیل ایمونوهیستوشیمی و فلورسانس بیومارکرهای بافت بررسی می شود. آسیب شناسی دیجیتال و تجزیه و تحلیل تصویر نقش مهمی در خط لوله های تشخیصی مواد مخدر / ترکیبی از جمله زیست شناسی، آسیب شناسی مولکولی، تجزیه و تحلیل میکروارگانیسم بافت، پروفایل مولکولی بافت و این پیشرفت های مهم بررسی شده است. بر اساس همه این پیشرفت های مهم، نیاز به نمونه های بافت با کیفیت بالا و تاثیر متغیرهای پیش تحلیل شده در تحقیقات بافتی مورد بحث قرار گرفته است. این الزام با توصیه های عملی در راه اندازی و آزمایش آزمایشگاه آسیب شناسی دیجیتالی همراه است. در نهایت، ما در مورد نیاز به ادغام داده های تجزیه و تحلیل داده های دیجیتال با داده های اپیدمیولوژیکی، بالینی و ژنومیک به منظور کاملا درک رابطه بین ژنوتیپ و فنوتیپ و کشف و تحویل پزشکی شخصی مورد بحث قرار می دهیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Digital pathology and the adoption of image analysis have grown rapidly in the last few years. This is largely due to the implementation of whole slide scanning, advances in software and computer processing capacity and the increasing importance of tissue-based research for biomarker discovery and stratified medicine. This review sets out the key application areas for digital pathology and image analysis, with a particular focus on research and biomarker discovery. A variety of image analysis applications are reviewed including nuclear morphometry and tissue architecture analysis, but with emphasis on immunohistochemistry and fluorescence analysis of tissue biomarkers. Digital pathology and image analysis have important roles across the drug/companion diagnostic development pipeline including biobanking, molecular pathology, tissue microarray analysis, molecular profiling of tissue and these important developments are reviewed. Underpinning all of these important developments is the need for high quality tissue samples and the impact of pre-analytical variables on tissue research is discussed. This requirement is combined with practical advice on setting up and running a digital pathology laboratory. Finally, we discuss the need to integrate digital image analysis data with epidemiological, clinical and genomic data in order to fully understand the relationship between genotype and phenotype and to drive discovery and the delivery of personalized medicine.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 70, Issue 1, November 2014, Pages 59-73
نویسندگان
, , , , , , , ,