کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10825813 | 1064676 | 2013 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Transcriptome-wide identification of RNA binding sites by CLIP-seq
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
An emergent strategy for the transcriptome-wide study of protein-RNA interactions is CLIP-seq (crosslinking and immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing). We combined CLIP-seq and mRNA-seq to identify direct RNA binding sites of eIF4AIII in human cells. This RNA helicase is a core constituant of the Exon Junction Complex (EJC), a multifunctional protein complex associated with spliced mRNAs in metazoans. Here, we describe the successive steps of the CLIP protocol and the computational tools and strategies we employed to map the physiological targets of eIF4AIII on human RNAs.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 63, Issue 1, 1 September 2013, Pages 32-40
Journal: Methods - Volume 63, Issue 1, 1 September 2013, Pages 32-40
نویسندگان
Valentine Murigneux, Jérôme Saulière, Hugues Roest Crollius, Hervé Le Hir,