Metabolic network modeling approaches for investigating the “hungry cancer”

متابولیسم فنوتیپ کارکردی یک سلول است، در یک شرایط خاص، که منجر به تعامل پیچیده فرآیندهای تنظیم کننده ای مختلف می شود. مطالعه این پروسه های متابولیسم پویا و قابلیت های آنها به شناسایی خواص بنیادی سیستم های زندگی کمک می کند. مقررات غربالگری متابولیک یکی از نشانه های ظهور سلول های سرطانی است. این مقررات غلط ارزیابی منجر به ایجاد مجدد مدارهای متابولیک مزیت متابولیک استثنایی برای سلول های تومور می شود که منجر به منفعت متمایز در بقاء می شود و پایه ای برای پیشرفت ناخواسته را فراهم می آورد. متابولیسم را می توان به عنوان یک نظام آزاد ترمودینامیکی در نظر گرفت که در آن مبنای منبع با ارزش بالا از طریق یک سیستم تبدیل بیوشیمیایی مرتبط به هم پیوسته، به شدت زیر اصول فیزیولوژیکی، تولید واسطه های مفید و در نهایت منجر به آزاد سازی فرآورده های جانبی می شود. بر اساس این اصل اساسی توازن ورودی / خروجی، مدل های مختلف برای بررسی متابولیسم توسعه داده شده است که ویژگی های عملکردی آن را توضیح می دهد. با این حال، فقط چند روش مدل سازی ثابت شده است که در محاسبه ماهیت متابولیک سرطان در یک سطح سیستم قابل اثبات است. علاوه بر این، رویکردهای آماری برای شناسایی مسیرهای بیوشیمیایی که بیشتر مربوط به انواع خاصی از سلول های تومور هستند، تنظیم شده است. در این بررسی، ما خلاصه ای از رویکردهای آماری اساسی و مفاهیم مدل سازی اصلی را معرفی می کنیم. ما تاکید بر روش ها و برنامه های کاربردی خود را که تا حد زیادی در درک متابولیک تغییر ساختار سرطان استفاده شده است.