کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
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1092385 | 1378380 | 2016 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Computational prediction of linear B-cell epitopes in the E5 oncoprotein of the human papillomavirus type 16 using several bioinformatics tools
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علوم زیستی و بیوفناوری
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چکیده انگلیسی
El virus del papiloma humano (VPH) es una de las infecciones de transmisión sexual más comunes en todo el mundo, que afecta a unos 300 millones de personas cada año. El gen E5 del VPH parece haber coevolucionado con los principales oncogenes E6 y E7 y su presencia en el genoma viral se correlaciona con el riesgo de cáncer. VPH-16 E5 es una oncoproteÃna con muchas funciones durante la infección del VPH-16. El desarrollo de los métodos computacionales para el descubrimiento de epÃtopos se convierte en una alternativa a las técnicas experimentales húmedas, con el fin de ahorrar tiempo y costes. En este trabajo las herramientas bioinformáticas: Predict Protein, BCPREDS (AAP, BCpreds y FBCPred), ABCpred, BepiPred, SVMTriP, LBtope, IEDB y LEPS se utilizaron con el fin de elucidar epÃtopos de células B en la proteÃna E5 del VPH-16 (VPH-16 E5). La estructura secundaria de la VPH-16 E5 se utilizó para mapear los epÃtopos de células B predichos en este estudio. Un total de 202 epÃtopos de células B y 44 epÃtopos de células B con actividad tumoral se obtuvieron con todas las herramientas bioinformáticas en conjunto. Se observaron diferencias en la proporción de estos epÃtopos en las 3 α-hélices de la estructura secundaria determinada por Predict Protein. Los epÃtopos predichos en este estudio podrÃan facilitar el diseño de futuras vacunas terapéuticas y la comprensión de los mecanismos inmunológicos de VPH-16.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Vacunas - Volume 17, Issue 1, JanuaryâJune 2016, Pages 18-26
Journal: Vacunas - Volume 17, Issue 1, JanuaryâJune 2016, Pages 18-26
نویسندگان
J.F. Beltrán Lissabet,