کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
1981802 | 1539421 | 2013 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
ATAF1 transcription factor directly regulates abscisic acid biosynthetic gene NCED3 in Arabidopsis thaliana
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ABADBDPBMNACPWMNCED3SnRKArabidopsis - آرابیدوپسیس یا رشادیDNA-binding - اتصال DNAabscisic acid - اسید آبسزیکDNA-Binding Domain - دامنه اتصال DNATranscription factor - عامل رونویسیNAC transcription factor - فاکتور رونویسی NACPosition weight matrix - ماتریس وزن موقعیتCHiP - چیپchromatin-immunoprecipitation - کروماتین-ایمن سازی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
ATAF1, an Arabidopsis thaliana NAC transcription factor, plays important roles in plant adaptation to environmental stress and development. To search for ATAF1 target genes, we used protein binding microarrays and chromatin-immunoprecipitation (ChIP). This identified T[A,C,G]CGT[A,G] and TT[A,C,G]CGT as ATAF1 consensus binding sequences. Co-expression analysis across publicly available microarray experiments identified 25 genes co-expressed with ATAF1. The promoter regions of ATAF1 co-expressors were significantly enriched for ATAF1 binding sites, and TTGCGTA was identified in the promoter of the key abscisic acid (ABA) phytohormone biosynthetic gene NCED3. ChIP-qPCR and expression analysis showed that ATAF1 binding to the NCED3 promoter correlated with increased NCED3 expression and ABA hormone levels. These results indicate that ATAF1 regulates ABA biosynthesis.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: FEBS Open Bio - Volume 3, 2013, Pages 321-327
Journal: FEBS Open Bio - Volume 3, 2013, Pages 321-327
نویسندگان
Michael Krogh Jensen, Søren Lindemose, Federico de Masi, Julia J. Reimer, Michael Nielsen, Venura Perera, Chris T. Workman, Franziska Turck, Murray R. Grant, John Mundy, Morten Petersen, Karen Skriver,