کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2090427 | 1081501 | 2010 | 4 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
V-Xtractor: An open-source, high-throughput software tool to identify and extract hypervariable regions of small subunit (16 S/18 S) ribosomal RNA gene sequences
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
بیوتکنولوژی یا زیستفناوری
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
V-Xtractor (http://www.cmde.science.ubc.ca/mohn/software.html) uses Hidden Markov Models to locate, verify, and extract defined hypervariable sequence segments (V1-V9) from bacterial, archaeal, and fungal small-subunit rRNA sequences. With a detection efficiency of 99.6% and low susceptibility to false-positives, this tool refines data reliability and facilitates subsequent analysis in community assays.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Microbiological Methods - Volume 83, Issue 2, November 2010, Pages 250–253
Journal: Journal of Microbiological Methods - Volume 83, Issue 2, November 2010, Pages 250–253
نویسندگان
Martin Hartmann, Charles G. Howes, Kessy Abarenkov, William W. Mohn, R. Henrik Nilsson,