کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
2090427 1081501 2010 4 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
V-Xtractor: An open-source, high-throughput software tool to identify and extract hypervariable regions of small subunit (16 S/18 S) ribosomal RNA gene sequences
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی بیوتکنولوژی یا زیست‌فناوری
پیش نمایش صفحه اول مقاله
V-Xtractor: An open-source, high-throughput software tool to identify and extract hypervariable regions of small subunit (16 S/18 S) ribosomal RNA gene sequences
چکیده انگلیسی

V-Xtractor (http://www.cmde.science.ubc.ca/mohn/software.html) uses Hidden Markov Models to locate, verify, and extract defined hypervariable sequence segments (V1-V9) from bacterial, archaeal, and fungal small-subunit rRNA sequences. With a detection efficiency of 99.6% and low susceptibility to false-positives, this tool refines data reliability and facilitates subsequent analysis in community assays.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Microbiological Methods - Volume 83, Issue 2, November 2010, Pages 250–253
نویسندگان
, , , , ,