Genotyping of Chlamydia trachomatis from endocervical specimens of infertile Mexican women

IntroductionIt has been reported in several countries that Chlamydia trachomatis genotypes D, E, and F are the ones more frequently associated with urogenital infections. In Mexico, the prevalence of serovars and genotypes is unknown.Material and MethodsOne hundred and fifty-two endocervical swabs were collected from infertile women to test for C. trachomatis. The PCR-based RFLP and automated-sequencing methods of ompA gene was used to identify the C. trachomatis genotypes. Sequences of 891 pb obtained were aligned with currently available chlamydial sequences from GenBank to identify the corresponding genotype.ResultsTwenty-four women with infertility (15.8%) were positive for C. trachomatis. According to the RFLP and nucleotide sequences results the most prevalent ompA genotype corresponded to serovar F (n = 13 [54.2%]), followed by serovars E (n = 2 [8.7%]), G (n = 2 [8.7%]), K (n = 2 [8.7%]) and LGV (n = 2 [8.7%]), while serovars D, H and Ia were less prevalent (all n = 1 [4.2%]). None of the patients who were positive to genovar L2 had symptoms of lymphogranuloma venereum (LGV). Nucleotide sequences analysis showed a new genovariant of L2, which was different to L2b to L2f. Mutation points were observed in VS1 domain of Omp A.ConclusionsIn this study the most common genotypes were F. Furthermore, the L2 genovariants were demonstrated in infertile women without signs and symptoms of LGV disease. Presence of point mutations in L2 genotype sequences were seen by which there is a need for further research in order to identify new L2 genetic variants that exist in Latin America.

ResumenIntroducciónEn diversos países se ha informado que los genotipos de Chlamydia trachomatis más frecuentes y que están asociados a infecciones urogenitales son: D, E y F. En México, la prevalencia de los serotipos y genotipos no se conoce.Material y métodosSe obtuvieron ciento cincuenta y dos hisopos de muestras endocervicales de mujeres infértiles para detectar C. trachomatis. La identificación de los genotipos de C. trachomatis se realizó mediante la técnica de PCR basado en RFLP y en el método automatizado de secuenciación para el gen ompA. Para identificar el genotipo, la secuencia de 891 pb obtenida se alineó con secuencias del gen ompA de Chlamydia disponibles en el GenBank.ResultadosVeinticuatro mujeres con infertilidad (15,8%) fueron positivas para C. trachomatis. De acuerdo con los métodos de RFLP y de secuencición de nucleótidos, el genotipo más frecuente correspondió al serotipo F (n = 13 [54,2%]), seguida por el serotipo E (n = 2 [8,7%]), G (n = 2 [8,7%]), K (n = 2 [8,7%]) y L2 (n = 2 [8,7%]), mientras que los serotipos D, H e Ia fueron menos frecuentes (todos, n = 1 [4,2%]). Ninguno de los pacientes con resultado positivo para el serotipo L2 tuvo síntomas de linfogranuloma venéreo (LGV). El análisis de las secuencias nucleotídicas del serotipo L2 mostró una nueva genovariante diferente de la L2b a la L2F. Los puntos de mutación en esta nueva genovariante se observaron en el dominio VS1 del gen ompA.ConclusionesEn este estudio el genotipo más frecuente fue el F. Además, se demostró la presencia del genotipo L2 en mujeres infértiles que no mostraron signos y síntomas de la enfermedad de LGV. Se evidenciaron mutaciones puntuales en las secuencias nucleotídicas del genotipo L2 por lo cual hay necesidad de una mayor investigación para identificar la existencia de nuevas genovariantes L2 en América Latina.