کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
3407783 1593503 2008 4 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
SWeBLAST: A Sliding Window Web-based BLAST tool for recombinant analysis
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی ویروس شناسی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
SWeBLAST: A Sliding Window Web-based BLAST tool for recombinant analysis
چکیده انگلیسی

We describe a simple Perl computer tool for matching successive subsequences of a query sequence using the BLAST facilities of Genbank. SWeBLAST helps identify ‘parents’ of recombinant sequences, even when these are themselves unrelated, thus it is complementary to methods that compare sets of aligned homologous sequences, and avoids the significant problem of these methods in having first to decide which sequences to compare. SWeBLAST searches may also be valuable for checking the recombination history of genes proposed for use as transgenes.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Virological Methods - Volume 152, Issues 1–2, September 2008, Pages 98–101
نویسندگان
, , ,