Genetic diversity of Influenza B virus in 2009–2010 and 2010–2011 in Tunisia

ObjectiveThe authors had for aim to characterize influenza B strains having circulated in Tunisia to identify new mutations and compare them with reference strains.MethodsThe epidemiological surveillance of influenza allowed identifying 19 patients with symptoms related to respiratory infection, who had been infected by influenza B strains isolated in several regions of Tunisia in 2009–2010 and in 2010–2011. Laboratory identification and detection of mutations in the segment encoding hemagglutinin of influenza viruses was performed by real time PCR and sequencing.ResultsThe two influenza B Tunisian strains of the 2009–2010 season belonged to the Victoria lineage, whereas 2010–2011 season strains belonged to B/Victoria/2/87 and B/Yamagata/16/88 lineages with a dominance of the Yamagata lineage (76%). This study allowed identifying amino acid substitutions: T121A, S150I, N165Y, T181A, G183R, D196N, S229D, M251V and K253R in the B/Yamagata lineage; L58P, N75K, K109N, N165K, S172P and K257R into the B/Victoria lineage. These mutations were specific of Tunisian groups of variants. Most influenza B-Yamagata lineage viruses (69%) were associated with severe cases.ConclusionMolecular analysis of the various influenza B strains circulating in Tunisia is useful to detect new mutations that can modify the phenotype of influenza strains.

RésuméObjectifCaractériser les souches de la grippe B ayant récemment circulées en Tunisie afin de déceler les nouvelles mutations en comparaison avec les souches de référence.MéthodesDans le cadre de la surveillance épidémiologique de la grippe, 19 patients présentant des symptômes liés à l’infection des voies respiratoires se sont révélés infectés par le virus de la grippe B durant les deux saisons 2009–2010 et 2010–2011. L’identification ainsi que la détection des mutations dans le segment codant l’hémagglutinine des virus grippaux ont été réalisées au laboratoire par la technique de RT-PCR en temps réel et le séquençage.RésultatsIl s’est avéré que les deux souches Tunisiennes de la grippe B de la saison 2009–2010 appartiennent à la lignée Victoria, alors que les souches de la saison 2010–2011 sont des deux lignées B/Victoria/2/87 et B/Yamagata/16/88 avec une dominance de la lignée Yamagata (76 %). Cette étude a permis d’identifier des mutations à l’origine de substitutions d’acide aminé : T121A, S150I, N165Y, T181A, G183R, D196N, S229D, M251V et K253R dans la lignée B-Yamagata ; L58P, N75K, K109N, N165K, S172P et K257R dans la lignée B-Victoria. Ces mutations sont spécifiques de groupes de variants Tunisiens. La majorité des virus de la lignée Yamagata étudiés (69 %) sont associés à des cas graves.ConclusionsL’analyse moléculaire régulière des différentes souches de la grippe B circulant en Tunisie s’avère utile pour détecter de nouvelles mutations capables de modifier le phénotype des souches grippales.