کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
4964363 1447808 2017 19 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Computational efficiency and Amdahl's law for the adaptive resolution simulation technique
ترجمه فارسی عنوان
کارایی محاسباتی و قانون آمدال برای روش شبیه سازی سازگاری
کلمات کلیدی
شبیه سازی وضوح سازگار، قانون عدله عملکرد محاسباتی،
ترجمه چکیده
ما در مورد عملکرد محاسباتی تکنیک تفکیک سازگاری در شبیه سازی مولکولی بحث می کنیم، زمانی که آن را با شبیه سازی کامل متشکل از خرد دانه و کامل اتمیستیک مقایسه می کنیم. ما نشان می دهیم که برآورد راندمان آن، با دقت 10٪ -15٪، توسط قانون آمدال مطابق با مقادیر خاص درگیر در این مسئله است. مشتق فرمول پیش بینی به طور کلی به اندازه کافی است که ممکن است به روش کلی رویکردهای دینامیکی مولکولی که در آن کاهش درجه آزادی در حالت چند بعدی رخ می دهد، اعمال شود.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه شیمی شیمی تئوریک و عملی
پیش نمایش مقاله
کارایی محاسباتی و قانون آمدال برای روش شبیه سازی سازگاری
چکیده انگلیسی
We discuss the computational performance of the adaptive resolution technique in molecular simulation when it is compared with equivalent full coarse-grained and full atomistic simulations. We show that an estimate of its efficiency, within 10%-15% accuracy, is given by the Amdahl's Law adapted to the specific quantities involved in the problem. The derivation of the predictive formula is general enough that it may be applied to the general case of molecular dynamics approaches where a reduction of degrees of freedom in a multiscale fashion occurs.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computer Physics Communications - Volume 215, June 2017, Pages 20-25
نویسندگان
, , ,