The core regulatory network in human cells

به منظور کشف ویژگی های مشترک انواع سلول های مختلف در بدن انسان، بسیاری از تحقیقات انجام شده برای یافتن مجموعه ای از ژن هایی که معمولا در انواع سلول های مختلف و بافت ها بیان می شوند، انجام شده است. با این حال، ویژگی های عملکردی یک سلول به واسطه روابط تنظیم مقررات پیچیده بین ژن ها و نه توسط خود ژن های بیان شده تعیین می شود. بنابراین مهم تر است شناسایی و تجزیه و تحلیل یک شبکه اصلی نظارتی که در آن همه ارتباطات نظارتی بین ژن ها در تمام انواع سلول ها فعال است تا ویژگی های مشترک انواع مختلف سلول را کشف کنند. در اینجا، براساس صدها شبکه تنظیم کننده ژن اختصاصی بافت ساخته شده توسط دادههای تجربی اخیر ژنوم، ما شبکه اصلی نظارتی را ایجاد کردیم. جالب توجه است که ما متوجه شدیم که شبکه اصلی نظارتی با آبشار ساده سازماندهی شده است و مقررات پیچیده چندانی مانند بازخورد یا حلقه های خوراک پیش رو دارد. علاوه بر این، ما کشف کردیم که لینک های نظارتی از ژن ها در شبکه اصلی نظارتی به ژن ها در شبکه نظارتی محیطی بسیار بیشتر از لینک های معکوس هستند. این نتایج نشان می دهد که شبکه اصلی نظارتی در بالای شبکه نظارتی قرار دارد و از لحاظ جریان اطلاعات نقش مهمی را ایفا می کند و اطلاعاتی که برای همه سلول ها مشترک است، می تواند برای دستیابی به خصوصیات بافت از طریق تغییر انواع مختلف بازخورد و حلقه های خوراک جلو در شبکه های نظارتی محیطی. ما همچنین دریافتیم که ژن های موجود در شبکه اصلی نظارتی، ژن های ذخیره شده، ضروری و غیر بیماری، ژن های غیر قابل نگهداری در مقایسه با ژن های محیطی هستند. به طور کلی، مطالعه ما بینش را در مورد نحوه عملکرد کلی یک سلول در تمام سلول های بدن انسان به وجود می آورد و با انتقال و پردازش اطلاعات از طریق شبکه های نظارتی، ویژگی های عملکردی خاص بافت را تولید می کند.