کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5674718 1408254 2017 12 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Resequencing Helminth Genomes for Population and Genetic Studies
ترجمه فارسی عنوان
تعقیب ژن های هلمینت برای مطالعات جمعیت و ژنتیک
ترجمه چکیده
توالی نسل بعدی تبدیل شده است به طور فزاینده ای در دسترس و مقرون به صرفه است، و مطالعات گسترده ژنوم برای بسیاری از گونه ها، از جمله انسان ها، ارگانیسم های مدل و دام های خانگی معمول است. با این حال، در مورد انگل های هلمز، چالش های عملی عمده ای برای استفاده از این روش ها برای مطالعات ژنتیکی و جمعیت وجود دارد. ده ها تا صدها انگل فردی از جمعیت های چندگانه ممکن است نیاز به ترتیب مجدد داشته باشند که همراه با اندازه نسبتا بزرگ ژنوم های کلمینت هنوز هم می تواند کل ژنوم را در برابر انگل های فردی برای بسیاری از مطالعات غیر قابل قبول کند. خوشبختانه روشهای جایگزین برای توالی ژنومی کامل در هنگام انجام مطالعات ژنوم وجود دارد. در اینجا ما برخی از استراتژی ها را بررسی می کنیم، از جمله زیر نمونه برداری ژنومی و جمع آوری، که تجزیه و تحلیل گسترده ژنوم از تعداد زیادی از انگل در جمعیت را امکان پذیر می کند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی انگل شناسی
چکیده انگلیسی
Next-generation sequencing has become increasingly accessible and economical, making genome-wide studies routine for many species, including humans, model organisms, and domestic livestock. However, in the case of helminth parasites, there are still major practical challenges to the application of these approaches for genetic and population studies. Dozens to hundreds of individual parasites from multiple populations may need to be re-sequenced which, together with the relatively large size of helminth genomes, can still make whole-genome resequencing of individual parasites unfeasible for many studies. Fortunately, there are alternative approaches to the complete sequencing of genomes when conducting genome-wide studies. Here we review some strategies, including genome subsampling and pooling, that enable genome-wide analysis of large numbers of parasites in populations.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Trends in Parasitology - Volume 33, Issue 5, May 2017, Pages 388-399
نویسندگان
, ,