کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
571861 | 1452606 | 2014 | 10 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Tailoring strain construction strategies for muconic acid production in S. cerevisiae and E. coli
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
DHSF6PCmCSGPDHPCKDHBADAHPEDPEntner–Doudoroff pathwayEFMPTScis,cis-muconic acidAnthranilatePEPProtocatechuateCCMAADHFRDPPPPHBAE4PEMAG6PD3-dehydroshikimateEDA5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate2,3-dihydroxybenzoate - 2،3-دی هیدروکسی بنزواتEPSP - epspiPCA - PCAPps - PPSmalic enzyme - آنزیم مالیکErythrose 4-phosphate - اریتروسی 4-فسفاتAcetaldehyde dehydrogenase - استالدئید دهیدروژنازMAE - بلهElementary Mode Analysis - تجزیه و تحلیل حالت اولیهElementary flux modes - حالت شار اولیهAnth - دومSalicylate - سالیسیلاتphosphotransferase system - سیستم فسفات ترانسفرازCarbon yield - عملکرد کربنfructose-6-phosphate - فروکتوز 6-فسفاتphosphoenolpyruvate - فسفوآنولپیرواتphosphoenolpyruvate carboxykinase - فسفوآنولپیرود کربوکسیکینازphosphoenolpyruvate synthase - فسفوآنولپیرووا سنتازfumarate reductase - فومارات ردوکتازlactate dehydrogenase - لاکتات دهیدروژناز LDH - لاکتات دهیدروژناز به صورت مختصر شده LDH pentose phosphate pathway - مسیر پنتوز فسفاتwild type - نوع وحشیpyruvate kinase - پیرووات کینازPYK - پیکglucose-6-phosphate dehydrogenase - گلوکز 6-فسفات دهیدروژنازglycerol-3-phosphate dehydrogenase - گلیسرول 3-فسفات دهیدروژناز
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی شیمی
بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
There is currently a strong interest to derive the biological precursor cis,cis-muconic acid from shikimate pathway-branches to develop a biological replacement for adipic acid. Pioneered by the Frost laboratory this concept has regained interest: Recent approaches (Boles, Alper, Yan) however suffer from low product titres. Here an in silico comparison of all strain construction strategies was conducted to highlight stoichiometric optimizations. Using elementary mode analysis new knock-out strategies were determined in Saccharomyces cerevisiae and Escherichia coli. The strain construction strategies are unique to each pathway-branch and organism, allowing significantly different maximum and minimum yields. The maximum theoretical product carbon yields on glucose ranged from 86% (dehydroshikimate-branch) to 69% (anthranilate-branch). In most cases a coupling of product formation to growth was possible. Especially in S. cerevisiae chorismate-routes a minimum yield constraint of 46.9% could be reached. The knock-out targets are non-obvious, and not-transferable, highlighting the importance of tailored strain construction strategies.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Metabolic Engineering Communications - Volume 1, December 2014, Pages 19-28
Journal: Metabolic Engineering Communications - Volume 1, December 2014, Pages 19-28
نویسندگان
Nils J.H. Averesch, Jens O. Krömer,