کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6131552 1593038 2016 8 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The information science of microbial ecology
ترجمه فارسی عنوان
علم اطلاعات محیط زیست میکروبی
ترجمه چکیده
یک انقلاب در محیط زیست میکروبی رخ داده است که در آن پرونده های داده های چند منظوره با استفاده از توالی سنجی نسل بعدی و سامانه های طیف سنج جرم تولید می شود. این گیاه زراعی اطلاعات بیولوژیکی پتانسیل بسیار بالایی برای نشان دادن قدرت متابولیک مخفی جوامع میکروبی در اکوسیستم های طبیعی و مهندسی دارد. با این حال، برای تحقق این پتانسیل، توسعه فن آوری های جدید و چارچوب تفسیری مبتنی بر اصول طراحی اکولوژیک برای غلبه بر تنگناهای محاسباتی و تحلیلی ضروری است. در اینجا ما رابطه بین محیط زیست میکروبی و علوم اطلاعات را در دوران محاسبات مبتنی بر ابر بررسی می کنیم. ما میکروارگانیسم ها را به عنوان واحدهای پردازش اطلاعات فردی در نظر می گیریم که یک الگوریتم متابولیک توزیع شده را ارائه می دهند و تحولات را در محیط های اطلاعاتی و محاسبات همه جا انجام می دهند و توان بالقوه برای از بین بردن تنگناها و توانایی ایجاد دانش و ترجمه را دارند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی میکروب شناسی
پیش نمایش مقاله
علم اطلاعات محیط زیست میکروبی
چکیده انگلیسی
A revolution is unfolding in microbial ecology where petabytes of 'multi-omics' data are produced using next generation sequencing and mass spectrometry platforms. This cornucopia of biological information has enormous potential to reveal the hidden metabolic powers of microbial communities in natural and engineered ecosystems. However, to realize this potential, the development of new technologies and interpretative frameworks grounded in ecological design principles are needed to overcome computational and analytical bottlenecks. Here we explore the relationship between microbial ecology and information science in the era of cloud-based computation. We consider microorganisms as individual information processing units implementing a distributed metabolic algorithm and describe developments in ecoinformatics and ubiquitous computing with the potential to eliminate bottlenecks and empower knowledge creation and translation.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Microbiology - Volume 31, June 2016, Pages 209-216
نویسندگان
, , , , ,