کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6131826 1593042 2015 8 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Metabolic interactions in microbial communities: untangling the Gordian knot
ترجمه فارسی عنوان
تعاملات متابولیک در جوامع میکروبی: بیرون کشیدن گره گوردی
ترجمه چکیده
مبادلات متابولیک در جوامع میکروبی در همه جا حضور دارند. با این حال، تشخیص متابولیت متقابل تغذیه دشوار است به دلیل طبیعت پویا ذاتی و پیچیدگی جوامع. بنابراین، در حالی که توصیف جامع از شبکه های متابولیک در سیستم های طبیعی یک وظیفه برای آینده است، نبرد امروزه بین ویژگی های دقیق از کنسرسیوم های میکروبی پیچیده کوچک و کوچک، و تمرکز بر جنبه های متابولیک خاصی از اکوسیستم های طبیعی تقسیم می شود. تشخیص تعاملات متابولیک نیاز به ترکیب روش شناختی دارد که بتواند هویت گونه ها، وابستگی ها و ماهیت متابولیت های مبادله شده را ضبط کند. ترکیب چندگانه تکنیک های متنوع از متژنومیک تا طیف سنجی جرمی تصویری، راه حل هایی برای این چالش را ارائه می دهد، هر ترکیبی که به جامعه منتهی شده است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی میکروب شناسی
چکیده انگلیسی
Metabolic exchanges are ubiquitous in microbial communities. However, detecting metabolite cross-feedings is difficult due to their intrinsically dynamic nature and the complexity of communities. Thus, while exhaustive description of metabolic networks operating in natural systems is a task for the future, the battle of today is divided between detailed characterizations of small, reduced complexity microbial consortia, and focusing on particular metabolic aspects of natural ecosystems. Detecting metabolic interactions requires methodological blend able to capture species identity, dependencies and the nature of exchanged metabolites. Multiple combinations of diverse techniques, from metagenomics to imaging mass spectrometry, offer solutions to this challenge, each combination being tailored to the community at hand.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Microbiology - Volume 27, October 2015, Pages 37-44
نویسندگان
, ,