کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6131984 | 1593046 | 2015 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Ten years of pan-genome analyses
ترجمه فارسی عنوان
ده سال تجزیه و تحلیل پان ژنوم
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
ترجمه چکیده
تکنولوژی توالی نسل بعدی داده های توالی ژن را در پایگاه داده های عمومی به وجود آورده است. تجزیه و تحلیل ژنوم از ژنوم تک یا چند تا صدها تا هزاران ژنوم منتقل شده است. تجزیه و تحلیل پان ژنوم فراهم می کند چارچوب برای برآورد تنوع ژنومی از مجموعه داده ها در دست و پیش بینی تعداد توالی ژنوم کامل اضافی که لازم است به طور کامل مشخص کردن این تنوع. ما پیاده سازی های اخیر رویکرد پان ژنومی، تاثیر آن و محدودیت ها را بررسی می کنیم، و ما پیشنهاد می کنیم که پسوند احتمالی، از جمله تجزیه و تحلیل در کل سطح هماهنگی توالی ژنوم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
ایمنی شناسی و میکروب شناسی
میکروب شناسی
چکیده انگلیسی
Next generation sequencing technologies have engendered a genome sequence data deluge in public databases. Genome analyses have transitioned from single or few genomes to hundreds to thousands of genomes. Pan-genome analyses provide a framework for estimating the genomic diversity of the dataset at hand and predicting the number of additional whole genomes sequences that would be necessary to fully characterize that diversity. We review recent implementations of the pan-genome approach, its impact and limits, and we propose possible extensions, including analyses at the whole genome multiple sequence alignment level.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Microbiology - Volume 23, February 2015, Pages 148-154
Journal: Current Opinion in Microbiology - Volume 23, February 2015, Pages 148-154
نویسندگان
George Vernikos, Duccio Medini, David R Riley, Hervé Tettelin,