کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6131984 1593046 2015 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Ten years of pan-genome analyses
ترجمه فارسی عنوان
ده سال تجزیه و تحلیل پان ژنوم
ترجمه چکیده
تکنولوژی توالی نسل بعدی داده های توالی ژن را در پایگاه داده های عمومی به وجود آورده است. تجزیه و تحلیل ژنوم از ژنوم تک یا چند تا صدها تا هزاران ژنوم منتقل شده است. تجزیه و تحلیل پان ژنوم فراهم می کند چارچوب برای برآورد تنوع ژنومی از مجموعه داده ها در دست و پیش بینی تعداد توالی ژنوم کامل اضافی که لازم است به طور کامل مشخص کردن این تنوع. ما پیاده سازی های اخیر رویکرد پان ژنومی، تاثیر آن و محدودیت ها را بررسی می کنیم، و ما پیشنهاد می کنیم که پسوند احتمالی، از جمله تجزیه و تحلیل در کل سطح هماهنگی توالی ژنوم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی میکروب شناسی
چکیده انگلیسی
Next generation sequencing technologies have engendered a genome sequence data deluge in public databases. Genome analyses have transitioned from single or few genomes to hundreds to thousands of genomes. Pan-genome analyses provide a framework for estimating the genomic diversity of the dataset at hand and predicting the number of additional whole genomes sequences that would be necessary to fully characterize that diversity. We review recent implementations of the pan-genome approach, its impact and limits, and we propose possible extensions, including analyses at the whole genome multiple sequence alignment level.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Microbiology - Volume 23, February 2015, Pages 148-154
نویسندگان
, , , ,