کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6139398 1594231 2015 5 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Mutational bias of Turnip Yellow Mosaic Virus in the context of host anti-viral gene silencing
ترجمه فارسی عنوان
بایاس جهشی ویروس موزائیک زرد شلغم در زمینه فرونشانی پسا-نسخه برداری ژن ضد ویروس میزبان
کلمات کلیدی
فرونشانی پسا-نسخه برداری ژن ضد ویروس، ویروس موزاییک زرد شلغم، خردل چینی ، جمعیت ویروس، بایاس جهشی
فهرست مطالب مقاله
چکیده

کلمات کلیدی

مقدمه

نتایج و مباحث

مواد و روش‌ها

 
ترجمه چکیده
هنگام فرونشانی پسا نسخه برداری ژن ضد ویروس میزبان (پی.تی.جی.اس) یا همان (PTGS)، آنزیم‌های شبه-دایسر گیاهی (DCL) عملکرد اولویت‌بندی جی.سی را از خود نشان می‌دهند و فشار انتخابی تکاملی ایجاد می‌کنند و در نتیجه باعث پیدایش ویروس‌های گیاهی‌ای می‌شوند که ژنوم‌هایی با میزان جی.سی پایین دارند. با این حال، برخی ویروس‌ها مانند ویروس موزائیک زرد شلغم (تی.وای.ام.وی) یا همان (TYMV) دارای ژنوم‌های سرشار از جی.سی هستند و در مورد اینکه آیا فشار انتخابی دی.سی.ال بر روی این نوع ویروس‌ها تاثیر می‌گذارد یا خیر، گمانه‌زنی ایجاد می‌کنند. در این مطالعه آر.ان.ای های کوچک مشتق شده از برگ‌های خردل چینی آلوده به تی.وای.ام.وی را تحلیل کردیم که نشان داد جمعیت ویروس تی.وای.ام.وی با جایگزینی ای.یو AU)) با جی.سی GC)) و نشان دادن فشار پی.تی.جی.اس، از خود بایاس جهشی نشان دادند. جالب اینجاست که در سایت‌هایی که تا حد زیادی پلی مورفیک بودند، بایاس (GC-AU) مشاهده نشد. این امر نشان می‌دهد که وجود مکانیزم ناشناخته‌ای حتی با وجود فشار میزبان پی.تی.جی.اس، از رانش جهشی جمعیت ویروسی جلوگیری می‌نماید و ثبات ژنوم ویروسی را حفظ می‌کند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی ویروس شناسی
پیش نمایش مقاله
بایاس جهشی ویروس موزائیک زرد شلغم در زمینه فرونشانی پسا-نسخه برداری ژن ضد ویروس میزبان
چکیده انگلیسی
Plant Dicer-like (DCL) enzymes exhibit a GC-preference during anti-viral post-transcriptional gene silencing (PTGS), delivering an evolutionary selection pressure resulting in plant viruses with GC-poor genomes. However, some viruses, e.g. Turnip Yellow Mosaic Virus (TYMV, genus Tymovirus) have GC-rich genomes, raising the question as to whether or not DCL derived selection pressure affects these viruses. In this study we analyzed the virus-derived small interfering RNAs from TYMV-infected leaves of Brassica juncea showed that the TYMV population accumulated a mutational bias with AU replacing GC (GC-AU), demonstrating PTGS pressure. Interestingly, at the highly polymorphic sites the GC-AU bias was no longer observed. This suggests the presence of an unknown mechanism preventing mutational drift of the viral population and maintaining viral genome stability, despite the host PTGS pressure.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Virology - Volume 486, December 2015, Pages 2-6
نویسندگان
, , , , ,