کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6142108 1594339 2016 54 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Decoding protein networks during virus entry by quantitative proteomics
ترجمه فارسی عنوان
رمز نگاری شبکه های پروتئینی در طی ورود ویروس توسط پروتئومیک های کمی
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
ورود ویروس به سلول های میزبان بر متابولیسم ساختارهای ویروسی و میزبان، از جمله چربی ها، کربوهیدرات ها و پروتئین ها متکی است. به طور خاص، متابولیسم پروتئین-پروتئین بین پروتئین های سطح ویروسی و پروتئین های میزبان و همچنین متابولیسم پروتئین و پروتئین ثانویه میزبان نقش مهمی در هماهنگی اتصال و جذب ویروس ها دارد. این تعاملات پویا هستند و اغلب شامل مجتمع های چند پروتئین هستند. در دهه گذشته، روشهای پروتئومیک مبتنی بر طیف سنجی جرم به حساسیت و سازگاری بالا با توان بالا از روش های ژنومیک دسترسی پیدا کرده و در حال حاضر به کمترین مقدار پروتئین در نمونه های پیچیده از مواد محدود اجازه می دهد. همانطور که پروتئومیکس اطلاعات ضروری در مورد موجودات بیولوژیکی فعال مانند پروتئین، از جمله تغییرات پس از انتقال و تعاملات آن با دیگر پروتئین ها را فراهم می کند، در روش جعبه ابزار ویروس شناس، یک روش ضروری است. در اینجا ما در طی ورود ویروس به پروتئین ها بررسی و مقایسه روش های بیوشیمی کلاسیک برای مطالعه ورود با تکنیک های پیشرفته کم پروتئومیک پیشرفته. ما ارزش پروتئومیک های کمی را در نقشه برداری از شبکه های ورودی ویروس های کاربردی برجسته می کنیم، درباره مزایا و محدودیت ها بحث خواهیم کرد و نشان خواهیم داد که چگونه روش شناسی در آینده در تحقیق در مورد ورود ویروس کمک خواهد کرد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی ویروس شناسی
چکیده انگلیسی
Virus entry into host cells relies on interactions between viral and host structures including lipids, carbohydrates and proteins. Particularly, protein-protein interactions between viral surface proteins and host proteins as well as secondary host protein-protein interactions play a pivotal role in coordinating virus binding and uptake. These interactions are dynamic and frequently involve multiprotein complexes. In the past decade mass spectrometry based proteomics methods have reached sensitivities and high throughput compatibilities of genomics methods and now allow the reliable quantitation of proteins in complex samples from limited material. As proteomics provides essential information on the biologically active entity namely the protein, including its posttranslational modifications and its interactions with other proteins, it is an indispensable method in the virologist's toolbox. Here we review protein interactions during virus entry and compare classical biochemical methods to study entry with novel technically advanced quantitative proteomics techniques. We highlight the value of quantitative proteomics in mapping functional virus entry networks, discuss the benefits and limitations and illustrate how the methodology will help resolve unsettled questions in virus entry research in the future.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Virus Research - Volume 218, 15 June 2016, Pages 25-39
نویسندگان
, , ,