کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6368989 1623803 2016 16 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Phylogenetic effective sample size
ترجمه فارسی عنوان
اندازه نمونه موثر فیلوژنتیک
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
In this paper I address the question-how large is a phylogenetic sample? I propose a definition of a phylogenetic effective sample size for Brownian motion and Ornstein-Uhlenbeck processes-the regression effective sample size. I discuss how mutual information can be used to define an effective sample size in the non-normal process case and compare these two definitions to an already present concept of effective sample size (the mean effective sample size). Through a simulation study I find that the AICc is robust if one corrects for the number of species or effective number of species. Lastly I discuss how the concept of the phylogenetic effective sample size can be useful for biodiversity quantification, identification of interesting clades and deciding on the importance of phylogenetic correlations.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 407, 21 October 2016, Pages 371-386
نویسندگان
,