کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6964984 | 1452430 | 2017 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Tools for building de novo transcriptome assembly
ترجمه فارسی عنوان
ابزار برای ساخت مجله ترنسپکتومی دی نوو
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی شیمی
بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
چکیده انگلیسی
The availability of RNA-Seq method allows researchers to capture the spatial or temporal profile of transcriptomes from various types of biological samples. The transcriptome data from a species can be analyzed in the context of its sequenced genomes or closely related genome to score biological sample-specific transcript isoforms, novel transcribed regions and to refine gene models including identification of new genes, in addition to the differential gene expression analysis. However, many plant species of importance currently lack a sequenced genome or a closely related reference genome and thus, rely on the de novo methods for generating transcript models and transcriptome assemblies. Here we describe various tools used for de novo transcriptome assembly and discuss the data management practices and standards.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Plant Biology - Volumes 11â12, September 2017, Pages 41-45
Journal: Current Plant Biology - Volumes 11â12, September 2017, Pages 41-45
نویسندگان
Matthew Geniza, Pankaj Jaiswal,