کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
7557552 | 1491344 | 2016 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Production of a soluble single-chain variable fragment antibody against okadaic acid and exploration of its specific binding
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
PDBCLEIAOVAPBSTDSPIC50scFvRMSDIPTGCDRPBSPBS containing 0.1% Tween 20 - PBS حاوی 0.1٪ Tween 20SDS–PAGE - SDS-PAGEAlkaline phosphatase - آلکالین فسفاتاز یا فسفاتاز قلیاییChemiluminescent enzyme immunoassay - آنزیم Chemiluminescent immunoassayOkadaic acid - اسید اوکادائیکsodium dodecyl sulfate–polyacrylamide gel electrophoresis - الکتروفورز ژل دوده سولفات سدیم پلی آکریل آمیدOvalbumin - اوبلبومینisopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside - ایزوپروپیل β-D-1-thiogalactopyranosideELISA - تست الیزاEnzyme-linked immunosorbent assay - تست الیزاLOD یا Limit of detection - حد تشخیصDiscovery Studio - دیسکاوری استودیوMolecular dynamics - دینامیک ملکولی یا پویایی مولکولیsingle-chain variable fragment - قطعه متغیر تک زنجیره ایlimit of detection - محدودیت تشخیصPhosphate-buffered saline - محلول نمک فسفات با خاصیت بافریDiarrhetic Shellfish Poisoning - مسمومیت با اسهال خشخاشComplementarity-determining region - منطقه تعریف کننده تکمیلیroot mean square deviation - میانگین انحراف مربع ریشهpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازProtein Data Bank - پروتئین بانک اطلاعاتی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
شیمی
شیمی آنالیزی یا شیمی تجزیه
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
Okadaic acid is a lipophilic marine algal toxin commonly responsible for diarrhetic shellfish poisoning (DSP). Outbreaks of DSP have been increasing and are of worldwide public health concern; therefore, there is a growing demand for more rapid, reliable, and economical analytical methods for the detection of this toxin. In this study, anti-okadaic acid single-chain variable fragment (scFv) genes were prepared by cloning heavy and light chain genes from hybridoma cells, followed by fusion of the chains via a linker peptide. An scFv-pLIP6/GN recombinant plasmid was constructed and transformed into Escherichia coli for expression, and the target scFv was identified with IC-CLEIA (chemiluminescent enzyme immunoassay). The IC15 was 0.012 ± 0.02 μg/L, and the IC50 was 0.25 ± 0.03 μg/L. The three-dimensional structure of the scFv was simulated with computer modeling, and okadaic acid was docked to the scFv model to obtain a putative structure of the binding complex. Two predicted critical amino acids, Ser32 and Thr187, were then mutated to verify this theoretical model. Both mutants exhibited significant loss of binding activity. These results help us to understand this specific scFv-antigen binding mechanism and provide guidance for affinity maturation of the antibody in vitro. The high-affinity scFv developed here also has potential for okadaic acid toxin detection.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Analytical Biochemistry - Volume 503, 15 June 2016, Pages 21-27
Journal: Analytical Biochemistry - Volume 503, 15 June 2016, Pages 21-27
نویسندگان
Kuo He, Xiuyuan Zhang, Lixia Wang, Xinjun Du, Dong Wei,