Details of charge distribution in stable viral capsid

ما نتایج شبیه سازی های مولکولی دینامیک یک کپسید ویروسی را با هدف تجزیه و تحلیل توزیع یون در سطح کپسید که ثبات آن را تعیین می کند، ارائه می کنیم. دو سیستم مدل سازی شد، یک کپسول پایدار با تعداد خنثی یون ها و یک کپسید ناپایدار با تعداد کم یون ها. برای تجزیه و تحلیل توزیع یون ساختار کپسید یکسان بود و در هر دو شبیه سازی ثابت شد. سپس آن را برای تجزیه و تحلیل ثبات منتشر شد. توزیع یون نشان دهنده دو نوع ناحیه های محلی در سطح داخلی دیواره کپسید است: به شدت با یون های کلرید در هر دو سیستم با وجود پتانسیل الکترواستاتیک تا حد زیادی یکنواخت در سطح و مناطق که اسید را از دست می دهند، اشغال شده است. مناطق دومی در نزدیکی شکاف هایی قرار دارند که وقتی کپسید بی ثبات می شود شکل می گیرد و بنابراین می تواند فروپاشی کلسیم را آغاز کند.