کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8292980 | 1536741 | 2018 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A statistical analysis on transcriptome sequences: The enrichment of Alu-element is associated with subcellular location
ترجمه فارسی عنوان
یک تجزیه و تحلیل آماری در توالی های ترانس کاپیتوم: غنی سازی عنصر آلو با مکان های سلولی مرتبط است
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
آلومینیوم موقعیت مکانی سلولی، ترانسکتیکوم تحلیل آماری،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
چکیده انگلیسی
The Alu-element plays important roles in mediating alternative splicing, RNA editing and translation regulation. However, the distribution and function of the Alu-element are never analysed at the transcriptome level. This study presents a statistical analysis of the Alu-element on human transcriptome. We found that mRNAs and lncRNAs share the same sequence form for the Alu-element. The Alu-element covers 5.8% of the coding transcripts and 17.1% of the coding genes for mRNAs, and covers 9.3% of the transcripts and 13.6% of the genes for lncRNAs. The Alu-element is preferentially located at the 3â² end. Statistical analysis demonstrates that the enrichment of Alu-element is associated with subcellular location. For instance, Alu-inclusive transcripts are overexpressed in nucleus, mitochondrion and Golgi apparatus membrane while under-expressed in cell membrane and extracellular space. We found that genes contain both Aluâelement and Sâ domains of 7SL RNA are all associated with cellular activities carried out in mitochondrion.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 499, Issue 3, 15 May 2018, Pages 397-402
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 499, Issue 3, 15 May 2018, Pages 397-402
نویسندگان
Ke Chen, Yuxuan Wang, Jie Sun,