Current trends and challenges in proteomic identification of protease substrates

جداسازی پروتئولیتیک یک اصلاح کامل و غیر قابل برگشت، پس از انتقال است که ساختار و عملکرد پروتئین را تغییر می دهد و نقش مهمی در فرآیندهای فیزیولوژیکی و پاتولوژیک دارد. در طی دهه گذشته، پروتئازها اهداف کلیدی بالاتری را مهم می دانند زیرا بسیاری از مهار کننده های آنها در حال حاضر در کلینیک یا در مراحل مختلف آزمایش بالینی استفاده می شود. بنابراین، درک بهتر از عمل پروتئازی و رپرتوایورهای آنها در زیربنای فیزیولوژیکی نه تنها می تواند بینش مهمی در مکانیزم های عملکرد آنها ایجاد کند، بلکه راه را برای طراحی داروهای جدید باز می کند. از لحاظ تاریخی، پروتئازها و زیربناهای آنها به طور خاص مورد مطالعه قرار گرفتند، اما پیشرفت های اخیر در پروتئومیک مبتنی بر طیف سنجی جرم، مطالعات پروتئولزی را در مقیاس جهانی انجام داده اند. از آنجا که انواع مختلفی از پروتئین ها وجود دارد که می توانند در زمینه های مختلف سلولی عمل کنند، رویکردهای متعدد تجربی برای مشخص کردن ویژگی های زیست محیطی آنها باید توسعه یابد. در این مقاله رویکردهای مبتنی بر طیف سنجی جرمی برای تعیین وقایع پروتئولیتیک در نمونه های بیولوژیکی پیچیده بررسی شده است. روشها برای شناسایی بستر و تعیین خاصیت پروتئاز مورد بحث قرار گرفته است، با تمرکز ویژه بر استراتژیهای اصطلاحات، که برچسب زدن و غنی سازی پپتید را ترکیب می کنند.