Dissecting cancer heterogeneity - An unsupervised classification approach

مطالعات طبقه بندی مبتنی بر ژن تغییر کرده است که سرطان به طور سنتی درک شده است. در حال تبدیل شدن به طور فزاینده ای روشن است که بسیاری از انواع سرطان در واقع بیماری های تک نیستند، بلکه شامل چندین نوع متمایز مولکولی هستند. در این بررسی، ما در مورد مطالعات طبقه بندی بی نظیری از بدخیمی های رایج در سال های اخیر بحث می کنیم. ما دریافتیم که جریان گردش اطلاعات بیوانفورماتیک بسیاری از این مطالعات پس از یک جریان اصلی رایج، هرچند ابزارهای آماری متفاوت ممکن است از مورد به مورد ترجیح داده شود. در اینجا ما روشهای کارآمد را خلاصه می کنیم، با تمرکز ویژه بر خوشه بندی و طبقه بندی اجماع. برای هر مرحله انتقادی از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک، ما بیانیه بیولوژیکی و پیامدهای اصول فنی را توضیح می دهیم. ما فکر می کنیم که درک بهتر این روش ها که اغلب استفاده می شود برای بررسی ناهمگنی سرطان توسط جامعه بیومدیکال مناسب است زیرا این نوع مطالعات تأثیر مهمی بر طبقه بندی بیمار و توسعه داروهای خاص زیر نوع سرطان در آینده خواهد داشت.