کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8340169 1541197 2017 9 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Bioinformatics approaches to predict target genes from transcription factor binding data
ترجمه فارسی عنوان
روش های بیوانفورماتیک برای پیش بینی ژن های هدف از داده های اتصال فاکتور رونویسی است
کلمات کلیدی
بیوانفورماتیک، عامل رونویسی، تقویت کننده، سازنده، تعاملات نظارتی، سرطان،
ترجمه چکیده
با هدف شناسایی ژن های عامل فاکتور رونویسی، رویکردهای در دسترس از مجموعه داده های تجربی فاکتور رونویسی استفاده می شود. ما نشان می دهیم که رویکرد ها همیشه قادر به توضیح تمام سایت های مرتبط با فاکتور رونویسی نیستند. سایت های مرتبط باید به طور غیرمستقیم درمان شوند و ترکیبی از رویکردها می تواند رابطه بیولوژیکی مجموعه ای از ژن های شناسایی شده به عنوان اهداف را افزایش دهد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
With the aim of identifying transcription factor target genes, we apply available approaches to typical transcription factor experimental datasets. We show that approaches are not always capable of annotating all transcription factor binding sites; binding sites should be treated disparately; and a combination of approaches can increase the biological relevance of the set of genes identified as targets.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 131, 1 December 2017, Pages 111-119
نویسندگان
, , , ,