کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8340489 | 1541237 | 2015 | 13 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Probing structures of large protein complexes using zero-length cross-linking
ترجمه فارسی عنوان
ساختار پروتئین های پروتئین های بزرگ با استفاده از اتصال متقابل صفر
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
طیف سنجی جرمی، ساختار، پیوند شیمیایی، صفر طول متقابل، شناسایی صلیب لینک، مدلسازی مولکولی،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Structural mass spectrometry (MS) is a field with growing applicability for addressing complex biophysical questions regarding proteins and protein complexes. One of the major structural MS approaches involves the use of chemical cross-linking coupled with MS analysis (CX-MS) to identify proximal sites within macromolecules. Identified cross-linked sites can be used to probe novel protein-protein interactions or the derived distance constraints can be used to verify and refine molecular models. This review focuses on recent advances of “zero-length” cross-linking. Zero-length cross-linking reagents do not add any atoms to the cross-linked species due to the lack of a spacer arm. This provides a major advantage in the form of providing more precise distance constraints as the cross-linkable groups must be within salt bridge distances in order to react. However, identification of cross-linked peptides using these reagents presents unique challenges. We discuss recent efforts by our group to minimize these challenges by using multiple cycles of LC-MS/MS analysis and software specifically developed and optimized for identification of zero-length cross-linked peptides. Representative data utilizing our current protocol are presented and discussed.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 89, 1 November 2015, Pages 99-111
Journal: Methods - Volume 89, 1 November 2015, Pages 99-111
نویسندگان
Roland F. Rivera-Santiago, Sira Sriswasdi, Sandra L. Harper, David W. Speicher,