کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8340564 | 1541241 | 2015 | 14 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Bayesian inference of reaction kinetics from single-cell recordings across a heterogeneous cell population
ترجمه فارسی عنوان
استنتاج بیزی از سینتیک واکنش از ضبط تک سلولی در یک جمعیت سلولی ناهمگن
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
استنتاج بیزی، مدل های تصادفی، تنوع سلولی به سلول،
ترجمه چکیده
تکنیکهای آزمایش تک سلولی اطلاعات مفیدی را برای کمک به کشف فرایندهای دینامیکی در داخل سلول فراهم می کنند. استفاده کامل از چنین اطلاعاتی نیازمند روش های محاسباتی اختصاصی برای تخمین پارامترهای فرآیند بیوفیزیکی و حالت ها در یک روش مبتنی بر مدل است. به طور خاص، درمان ناهمگونی یا تنوع سلولی به سلول مورد توجه خاصی است. در مقاله حاضر مقدمه ای بر یک کلاس خاص از الگوریتم ها ارائه می شود که حاوی حاشیه سازی هستند تا ناهمگونی را در نظر بگیرند. یک مقایسه کلی از رویکردهای جایگزین ارائه شده است. ما دو سناریو اغلب در آزمایشات تک سلولی، یعنی داده های مسیر تک سلولی و داده های توزیع تک سلولی را درمان می کنیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Single-cell experimental techniques provide informative data to help uncover dynamical processes inside a cell. Making full use of such data requires dedicated computational methods to estimate biophysical process parameters and states in a model-based manner. In particular, the treatment of heterogeneity or cell-to-cell variability deserves special attention. The present article provides an introduction to one particular class of algorithms which employ marginalization in order to take heterogeneity into account. An overview of alternative approaches is provided for comparison. We treat two frequently encountered scenarios in single-cell experiments, namely, single-cell trajectory data and single-cell distribution data.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 85, 1 September 2015, Pages 22-35
Journal: Methods - Volume 85, 1 September 2015, Pages 22-35
نویسندگان
L. Bronstein, C. Zechner, H. Koeppl,