Exploiting the multiplexing capabilities of tandem mass tags for high-throughput estimation of cellular protein abundances by mass spectrometry

تولید مدل های پویا از فرایندهای بیولوژیکی به طور عمده به تعیین دقیق غلظت سلول های بیومولکول بستگی دارد. اندازه گیری مقادیر مطلق پروتئین در سطح سیستم به ویژه اطلاعات ارزشمندی در زیست شناسی سیستم می باشد. اخیرا روشهای پروتئومیک مبتنی بر طیف سنجی جرمی برای تخمین غلظت پروتئین در مقیاس وسیع پروتئوم توسعه داده شده است. با این حال، برای پروتئین های بسیار پیچیده، مراحل تقسیم بندی مورد نیاز است، افزایش تعداد نمونه ها و زمان تجزیه و تحلیل ابزار. به عنوان یک نتیجه، تعداد پروتئام کامل که می تواند به طور مرتب تجزیه و تحلیل شود محدود است. در اینجا ما استراتژی های کوانتومی مطلق را با قابلیت های چندگانه ای از تگ های توده ای توده ای ایزوباریک برای تعیین فراوانی پروتئین سلولی در مقیاس بالا و پروتئوم گسترده حتی برای سیستم های بیولوژیک بسیار پیچیده مانند یک سلول انسانی کامل ترکیب می کنیم. ما دو مجموعه داده مستقل را برای نشان دادن قدرت رویکرد در مورد توان نمونه، محدوده دینامیکی، دقت کمی و دقت کمی و همچنین پوشش پروتئوم در مقایسه با استراتژی مبتنی بر طیف سنج جرمی موجود ایجاد کردیم.