کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8646372 | 1570112 | 2017 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Co-expression network analysis identified six hub genes in association with progression and prognosis in human clear cell renal cell carcinoma (ccRCC)
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
SAMPPISTRINGWGCNADEGsccRCCTCGAToMGSEASearch Tool for the Retrieval of Interacting Genes - ابزار جستجو برای بازیابی ژن های تعاملHuman Protein Atlas - اطلس پروتئین انسانیThe cancer genome atlas - اوتومتر ژنوم سرطانSignificance Analysis of Microarrays - تجزیه و تحلیل اهمیت MicroarraysWeighted gene co-expression network analysis - تجزیه و تحلیل شبکه همبستگی ژن با وزنProtein-protein interaction - تعامل پروتئین-پروتئینDAVID - دیویدClear cell renal cell carcinoma - سلول خونی سلولهای کلیهDEG - شماMeS - مسHPA - میلی بار یا هکتوپاسکالdatabase for annotation, visualization and integrated discovery - پایگاه داده برای حاشیه نویسی، تجسم و کشف یکپارچهprognosis - پیش شناخت بیماریProgression - پیشرفتDifferentially expressed gene - ژن بیان شده متفاوت استDifferentially expressed genes - ژن های متفاوت بیان شده استHub genes - ژنهای توپی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Human clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is one of the most common types of malignant adult kidney tumors. We constructed a weighted gene co-expression network to identify gene modules associated with clinical features of ccRCC (n = 97). Six hub genes (CCNB2, CDC20, CEP55, KIF20A, TOP2A and UBE2C) were identified in both co-expression and protein-protein interaction (PPI) networks, which were highly correlated with pathologic stage. The significance of expression of the hub genes in ccRCC was ranked top 4 among all cancers and correlated with poor prognosis. Functional analysis revealed that the hub genes were significantly enriched in cell cycle regulation and cell division. Gene set enrichment analysis suggested that the samples with highly expressed hub gene were correlated with cell cycle and p53 signaling pathway. Taken together, six hub genes were identified to be associated with progression and prognosis of ccRCC, and they might lead to poor prognosis by regulating p53 signaling pathway.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Genomics Data - Volume 14, December 2017, Pages 132-140
Journal: Genomics Data - Volume 14, December 2017, Pages 132-140
نویسندگان
Lushun Yuan, Liang Chen, Kaiyu Qian, Guofeng Qian, Chin-Lee Wu, Xinghuan Wang, Yu Xiao,