Bioinformatic prediction of plant-pathogenicity effector proteins of fungi

پروتئین های پروتئینی عامل مهمی برای بیماری های گیاهی قارچی هستند و پیش بینی آنها به روش های بیوانفورماتیک متکی است. در این بررسی ما روش های جاری برای پیش بینی پروتئین های پروتئینی تولید کننده بیماری های گیاهی قارچی را معرفی می کنیم. برخی از سازنده های قارچی مشخص شده اند و توسط موتیف های محافظت شده یا مخازن دنباله ای نشان داده شده اند، با این حال اکثر سازنده های قارچی به طور کلی حفاظت زیادی از توالی های اسید آمینه را نشان نمی دهند. بنابراین روش های مختلف پیش بینی شده در اطراف توسعه یافته است: خواص کلی، ساختار، موقعیت در چشم انداز ژنوم، و تشخیص جهش ها از جمله جهش های نقطه ناشی از تکرار و انتخاب مثبت. رویکرد ترکیبی که شامل چندین روش است اغلب مورد استفاده قرار می گیرد و نامزدها می توانند با توجه به نمرات رتبه بندی یا خوشه بندی سلسله مراتبی اولویت بندی شوند.