Go with the flow or solitary confinement: a look inside the single-cell toolbox for isolation of rare and uncultured microbes

با توجه به اینکه اکثریت قریب به اتفاق دنیای میکروبی هنوز غیرقابل انطباق یا کشف نشدهاند، میکروبشناسی نه تنها نیاز به تفکر اساسی بیشتری نسبت به نیازهای رشد میکروبی دارد، بلکه همچنین نیاز به تکنولوژیهای کوچک، چند منظوره و با توان بالا را برای پیشبرد استراتژیهای جداسازی میکروبی فعلی دارد. در این راستا، رویکردهای مبتنی بر تک سلولی به طور فزاینده ای راه خود را به آزمایشگاه میکروبشناسی می رسانند. تعدادی از مطالعات اخیر نشان داده است که تجزیه و تحلیل و جداسازی سلول های میکروبی آزاد با استفاده از مرتب سازی بر اساس جریان و همچنین محو شدن فاکتورهای فیزیکی سلول های فردی در محدوده میکرو محیط می تواند جداسازی گونه های قبلا غیرقابل کشت و کشف تاکسون های جدید میکروبی را تسهیل کند. با این حال، اگرچه بسیاری از این روش ها دسترسی سریع به توالی کامل ژنوم پایین دست را فراهم می کنند، افزایش چگالی سلول های بالاتر که مورد نیاز برای تشخیص متابولیسم و ​​حفظ اهداف حفظ می تواند چالش برانگیز باشد. پیش بینی می شود که این و دیگر چالش های تکنولوژیک در دوران نوآوری آینده مورد توجه قرار گیرد، ادغام ابزارهای تک سلولی در ابزارهای تجاری تجاری و پلت فرم سرویس، انتظار می رود که اکتشافات هدفمندتری در مواد تاریک میکروبی در عمق قابل مقایسه با متان ژنومیک باشد.