کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8919011 1642865 2017 20 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Advancing towards a global mammalian gene regulation model through single-cell analysis and synthetic biology
ترجمه فارسی عنوان
پیشرفت به سوی یک مدل تنظیم ژن پستانداران جهانی از طریق تجزیه تک سلولی و زیست شناسی مصنوعی
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
توابع ژنتیکی پیچیده مهندسی در سلول های پستانداران نیازمند مدل های پیش بینی کننده تنظیم ژن هستند. از آنجایی که بیان ژن به صورت تصادفی، منجر به ناهمگونی سلولی به سلول می شود، این مدل ها به اندازه گیری تک سلولی بستگی دارد. در اینجا، ما از میکروسکوپ های اخیر و اندازه گیری تک سلولی بر اساس رونویسی و تنظیم آن بر اساس کروماتین خلاصه شده است. سپس، ما روش های زیست شناختی مصنوعی را برای دستکاری کروماتین توصیف می کنیم و مشخص می کنیم چگونه می توان آنها را به اندازه گیری تک سلولی متصل کرد. ما در مورد مدل های نظری که برخی از ورودی های کروماتین را به خروجی های رونویسی متصل می کنند، بحث می کنیم. در نهایت، ما اشاره می کنیم که ارتباط بین مدل ها به ما اجازه می دهد که آنها را به یک عملکرد تنظیم کننده ژن خروجی ورودی-خروجی جهانی متصل کنیم.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه سایر رشته های مهندسی مهندسی پزشکی
چکیده انگلیسی
Engineering complex genetic functions in mammalian cells will require predictive models of gene regulation. Since gene expression is stochastic, leading to cell-to-cell heterogeneity, these models depend on single-cell measurements. Here, we summarize recent microscopy and sequencing-based single-cell measurements of transcription and its chromatin-based regulation. Then, we describe synthetic biology methods for manipulating chromatin, and highlight how they could be coupled to single-cell measurements. We discuss theoretical models that connect some chromatin inputs to transcriptional outputs. Finally, we point out the connections between the models that would allow us to integrate them into one global input-output gene regulatory function.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Biomedical Engineering - Volume 4, December 2017, Pages 174-193
نویسندگان
, , , ,