کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی ترجمه فارسی نسخه تمام متن
8956927 1646182 2018 23 صفحه PDF سفارش دهید دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Detection of single alpha-helices in large protein sequence sets using hardware acceleration
ترجمه فارسی عنوان
تشخیص تک آلفا هلیس در مجموعه توالی پروتئین های بزرگ با استفاده از شتاب سخت افزاری
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
سفارش ترجمه تخصصی
با تضمین قیمت و کیفیت
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شناسی مولکولی
چکیده انگلیسی
Single alpha-helices (SAHs) are increasingly recognized as important structural and functional elements of proteins. Comprehensive identification of SAH segments in large protein datasets was largely hindered by the slow speed of the most restrictive prediction tool for their identification, FT_CHARGE on common hardware. We have previously implemented an FPGA-based version of this tool allowing fast analysis of a large number of sequences. Using this implementation, we have set up of a semi-automated pipeline capable of analyzing full UniProt releases in reasonable time and compiling monthly updates of a comprehensive database of SAH segments. Releases of this database, denoted CSAHDB, is available on the CSAHserver 2 website at csahserver.itk.ppke.hu. An overview of human SAH-containing sequences combined with a literature survey suggests specific roles of SAH segments in proteins involved in RNA-based regulation processes as well as cytoskeletal proteins, a number of which is also linked to the development and function of synapses.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 204, Issue 1, October 2018, Pages 109-116
نویسندگان
, , , , , ,
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
سفارش ترجمه تخصصی
با تضمین قیمت و کیفیت