Efficient and extendible class scheme for the combined reaction-diffusion of multiple molecular species

هنگام برخورد با تعداد زیادی از سلول ها در شبیه سازی های بیوفیزیکی، مهم است که به درستی مواد مختلفی را که در سلول های اطراف و در اطراف آنها پخش می شود، مدیریت کنید. اگر چه در یک محیط برنامه نویسی شی گرا طبیعی است که سلول ها را به عنوان اشیاء اساسی تعریف کنیم، به نظر می رسد که مواد منفرد مناسب تر برای این نقش هستند. در اینجا ما مشکل بیوفیزیکی و راه حل محاسباتی ما را توصیف می کنیم و نتایج حاصل از یک مدل اسباب بازی را نشان می دهیم. ما دریافتیم که پیاده سازی جدید عملکرد را کاهش نمی دهد و در عین حال منجر به کد ساختاری و مدولار می شود. این برنامه های واقع گرایانه را با بسیاری از مسیرهای مولکولی بسیار مدولار و آسان گسترش می دهد.