کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10751736 | 1050319 | 2015 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Effect of different N7 substitution of dinucleotide cap analogs on the hydrolytic susceptibility towards scavenger decapping enzymes (DcpS)
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
DTTCBCeIF4EDcPSdithiotreitolC. elegans - C. elegansEnzyme kinetic - آنزیم سینتیکHIT - اصابتMRNA degradation - تخریب MRNAFluorescence titration - تیتراسیون فلورسانسeukaryotic initiation factor 4E - عامل آغاز کننده یوکاریوتی 4Ehistidine triad - هیستیدین سه گانهCap-binding complex - پیچ اتصال پیچCaenorhabditis elegans - کرم الگانس high performance liquid chromatography - کروماتوگرافی مایع با کارایی بالاHPLC - کروماتوگرافی مایعی کاراAscaris suum - کلزا
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Scavenger decapping enzymes (DcpS) are involved in eukaryotic mRNA degradation process. They catalyze the cleavage of residual cap structure m7GpppN and/or short capped oligonucleotides resulting from exosom-mediated the 3â² to 5â² digestion. For the specific cap recognition and efficient degradation by DcpS, the positive charge at N7 position of guanine moiety is required. Here we examine the role the N7 substitution within the cap structure on the interactions with DcpS (human, Caenorhabditis elegans and Ascaris suum) comparing the hydrolysis rates of dinucleotide cap analogs (m7GpppG, et7GpppG, but7GpppG, bn7GpppG) and the binding affinities of hydrolysis products (m7GMP, et7GMP, but7GMP, bn7GMP). Our results show the conformational flexibility of the region within DcpS cap-binding pocket involved in the interaction with N7 substituted guanine, which enables accommodation of substrates with differently sized N7 substituents.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 464, Issue 1, 14 August 2015, Pages 89-93
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 464, Issue 1, 14 August 2015, Pages 89-93
نویسندگان
Karolina Piecyk, Zbigniew M. Darzynkiewicz, Marzena Jankowska-Anyszka, Aleksandra Ferenc-Mrozek, Janusz Stepinski, Edward Darzynkiewicz, Elzbieta Bojarska,