کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10825751 | 1064668 | 2014 | 14 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
iCLIP: Protein-RNA interactions at nucleotide resolution
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
RNA-binding proteins (RBPs) are key players in the post-transcriptional regulation of gene expression. Precise knowledge about their binding sites is therefore critical to unravel their molecular function and to understand their role in development and disease. Individual-nucleotide resolution UV crosslinking and immunoprecipitation (iCLIP) identifies protein-RNA crosslink sites on a genome-wide scale. The high resolution and specificity of this method are achieved by an intramolecular cDNA circularization step that enables analysis of cDNAs that truncated at the protein-RNA crosslink sites. Here, we describe the improved iCLIP protocol and discuss critical optimization and control experiments that are required when applying the method to new RBPs.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 65, Issue 3, February 2014, Pages 274-287
Journal: Methods - Volume 65, Issue 3, February 2014, Pages 274-287
نویسندگان
Ina Huppertz, Jan Attig, Andrea D'Ambrogio, Laura E. Easton, Christopher R. Sibley, Yoichiro Sugimoto, Mojca Tajnik, Julian König, Jernej Ule,