کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10826080 | 1064710 | 2011 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Quantitative profiling of serum samples using TMT protein labelling, fractionation and LC-MS/MS
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
HCDGeLC–MS/MSSAXTMTAMBICTBSACNFPLCCIDCollision-induced dissociation - اختلاف ناشی از برخوردAcetonitrile - استونیتریلHigher energy collisional dissociation - انحلال تصادفی انرژی بالاترTEAB - بدانیدAmmonium bicarbonate - بی کربنات آمونیومBiomarker - بیومارکرstrong anion exchange - تبادل قوی آنیونTris-buffered saline - تریس بافر شورTandem mass tags - تگ های دسته جمعیRoom temperature - دمای اتاقPancreatic cancer - سرطان پانکراسSerum - سرمMass spectrometry - طیف سنجی جرمیProteomic profiling - پروفیل پروتئومیک
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Blood-borne biomarkers are urgently required for the early detection, accurate diagnosis and prognosis of disease. Additionally, improved methods of profiling serum and plasma proteins for biomarker discovery efforts are needed. Herein, we report a quantitative method based on amino-group labelling of serum proteins (rather than peptides) with isobaric tandem mass tags (TMT) and incorporating immune-based depletion, gel-based and strong anion exchange separation of proteins prior to differential endoproteinase treatment and liquid chromatography tandem mass spectrometry. We report a generally higher level of quantitative coverage of the serum proteome compared to other peptide-based isobaric tagging approaches and show the potential of the method by applying it to a set of unique samples that pre-date the diagnosis of pancreatic cancer.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 54, Issue 4, August 2011, Pages 361-369
Journal: Methods - Volume 54, Issue 4, August 2011, Pages 361-369
نویسندگان
John Sinclair, John F. Timms,