کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10871033 | 1074032 | 2013 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Breaking the amyloidogenicity code: Methods to predict amyloids from amino acid sequence
ترجمه فارسی عنوان
شکستن کد آمیلوئیدوژنیک: روش پیش بینی آمیلوئید ها از توالی آمینو اسید
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ROCGFPPSSMNeurodegenerative disease - بیماری های نوروژنیکBioinformatics - بیوانفورماتیک Protein misfolding - غلظت پروتئینAmyloid fibril - فیبریل آمیلوئیدPosition specific scoring matrix - ماتریس نمره دهی خاص را بگذاریدreceiver operator characteristic - ویژگی اپراتور گیرندهgreen fluorescent protein - پروتئین فلورسنت سبزH-bond - پیوند HHydrogen bond - پیوند هیدروژنی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
دانش گیاه شناسی
چکیده انگلیسی
Numerous studies have shown that the ability to form amyloid fibrils is an inherent property of the polypeptide chain. This has lead to the development of several computational approaches to predict amyloidogenicity by amino acid sequences. Here, we discuss the principles governing these methods, and evaluate them using several datasets. They deliver excellent performance in the tests made using short peptides (â¼6 residues). However, there is a general tendency towards a high number of false positives when tested against longer sequences. This shortcoming needs to be addressed as these longer sequences are linked to diseases. Recent structural studies have shown that the core element of the majority of disease-related amyloid fibrils is a β-strand-loop-β-strand motif called β-arch. This insight provides an opportunity to substantially improve the prediction of amyloids produced by natural proteins, ushering in an era of personalized medicine based on genome analysis.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: FEBS Letters - Volume 587, Issue 8, 17 April 2013, Pages 1089-1095
Journal: FEBS Letters - Volume 587, Issue 8, 17 April 2013, Pages 1089-1095
نویسندگان
Abdullah B. Ahmed, Andrey V. Kajava,